Keberhasilan Kyai Bajuri Yusuf dalam bidang organisasi juga diikuti dengan keberhasilan dalam membina rumah tangga. Pernikahannya dengan seorang putri K. Helmi Teluk yang bernama Nyai Faizah pada tahun 1981 telah menghasilkan tiga orang putri dan dua orang putra, yaitu Fauziyah (alumni pesantren al-Fattah Lamongan), Ainun Jariyah (belajar di pesantren Darul Lughah Wadda’wah Bangil setelah meyelesaikan pertukaran  pelajar di Yaman), Ulfatun Najihah (maha siswa di perguruan tinggi Darul Lughah Wadda’wah Bangil), Muhammad Najahul Umam (belajar di pesantren Darul Lhughah Wadda’wah), dan Zah Faidh (belajar di pesantren Amtsilati Jepara Jawa Tengah).

Tentu saja keberhasiln terbesar beliau adalah keberhasilannya dalam membesarkan pesantren Hasan Jufri dengan sekolah-sekolah formal Madrasah Tsanawiyah dan Madrasah Aliyah. kedua sekolah tersebut menjadi sekolah terbesar Islam terbesar di pulau Bawean. Selain itu, beliau juga telah membesarkan para alumni yang mempunyai kiprah di masyarakat tidak hanya di Bawean tetapi juga di tempat-tempat lainnya.